Until 1998, all bottlenose dolphins were considered members of the single species T. truncatus. Cho đến năm 1998, tất cả các cá heo mũi chai Ấn Độ Dương được coi là thành viên của loài T. truncatus.
There is evidence the Indo-Pacific bottlenose dolphin may actually be more closely related to certain dolphin species in the genera Stenella and Delphinus, especially the Atlantic spotted dolphin (S. frontalis), than it is to the common bottlenose dolphin. Có bằng chứng cho thấy cá heo mũi chai Ấn Độ Dương thực sự có thể liên quan chặt chẽ hơn đối với các loài cá heo nhất định trong chi Stenella và Delphinus, đặc biệt là cá heo đốm Đại Tây Dương (S. frontalis), hơn là với cá heo mũi chai[4][7].